Clonagem e Caracterização do Gene da Quitinase de uma Cepa de Streptomyces Isolada de Solo de Cerrado

DOURADO, P. L. & BATAUS, L. A. M.

Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal de Goiás

E-mail: periclesdourado@pop.com.br / bataus@icb.ufg.br

Palavras-chave: caracterização, gene da quitinase, Streptomyces

 

 

INTRODUÇÃO

 

            O termo actinomiceto engloba uma enorme gama de bactérias que estão presentes em diversos ecossistemas. Tais organismos são imóveis, aeróbios (requerem constante agitação do meio de cultura para crescerem satisfatoriamente), mesófilos e heterotróficos. Microscopicamente são classificados como gram-positivos, ao passo que a nível macroscópico, suas colônias podem adquirir aspectos variados, sendo que, algumas espécies formam hifas aéreas que podem persistir na forma de micélio. Os actinomicetos também podem formar esporos como um mecanismo de defesa contra possíveis adversidades que podem ser enfrentadas por eles no meio ambiente (escassez de água ou carência de nutrientes). Os actinomicetos apresentam uma cadeia de DNA riquíssima em guanina e citosina (G+C). São capazes de degradar polímeros de origem animal, vegetal e microbiana. Por fim, algumas cepas são capazes de participar ativamente do processo de fixação do nitrogênio em grande parte das plantas não leguminosas.

            O gênero Streptomyces envolve actinomicetos de grande importância biotecnológica por produzir um elevado número de metabólitos que despertam interesse nos seres humanos.

            Apesar de serem encontrados tanto em ambientes terrestres quanto aquáticos, são encontrados principalmente no solo. A maior parte destes microrganismos são saprofíticos, entretanto, alguns podem formar associações parasitárias com plantas ou animais.

            Estes procariotos apresentam uma diversificada produção de antibióticos clinicamente importantes. Nos últimos anos, genes envolvidos na biossíntese de antibióticos, pigmentos e outros metabólitos secundários foram clonados.

            Streptomicetos apresentam uma vasta importância no que diz respeito à degradação de vários polímeros do solo como hemicelulose, pectina, queratina, lignina e quitina. Até pouco tempo atrás, não havia trabalhos de clonagem molecular e análise de genes da quitinase de bactérias que não pertenciam ao grupo dos streptomicetos (TSUJIBO et al., 2003) até que verificou-se outros gêneros de actinomicetos também sintetizavam tal enzima. Estudos realizados na área da agricultura demonstraram o importante papel desempenhado por Streptomyces no controle biológico de alguns fungos fitopatógenos (GOMES et al., 2000; BLIFELD et al., 1999). Isso se deve pelo fato de que a parede celular de várias espécies diferentes de fungos é constituída por quitina, com isso, quitinases expressas por alguns microrganismos podem atacar determinados fungos utilizando as paredes de suas células como fonte de carbono e nitrogênio.

            Desta maneira, ótimos resultados foram obtidos utilizando a cepa Streptomyces lydicus WYEC108 para realizar o biocontrole de diferentes espécies de fungos (MAHADEVAN & CRAWFORD, 1997). A quitinase C (ChiC) de Streptomyces griseus HUT6037 também apresentou boa atividade inibitória do crescimento do fungo T. reesei (ITOH et al, 2002).

            Dentre as enzimas hidrolíticas mais estudadas dos Streptomyces, destacam-se as que compõem o complexo quitinolítico, as quais apresentam um vasto campo de utilização. Participam da produção de rações para animais a partir da bioconversão de rejeitos de quitina. Atuam como agente de biocontrole na microbiologia aplicada. Além disso, tais enzimas também são utilizadas no preparo de quitoligossacarídeos que mostraram atividade antitumoral (SHAIKH & DESHPANDE, 1993).

 

 

OBJETIVOS

 

            O objetivo do trabalho a ser executado é de realizar a clonagem e posterior caracterização do gene codificante da enzima quitinase, de uma bactéria do gênero Streptomyces isolada de amostras de solo do cerrado e mantida sob cultivo no laboratório de Bioquímica e Engenharia Genética da Universidade Federal de Goiás.

 

 

MATERIAIS E MÉTODOS

 

            Durante o desenvolvimento do projeto de dissertação de mestrado, serão executadas as seguintes atividades: coleta de diferentes amostras de solo; extração de DNA cromossomal (MARMUR, 1961); extração de DNA plasmidial (procedimento “miniprep”); purificação dos fragmentos de DNA; preparo e transformação de células competentes (INOUE et al., 1990), digestão do DNA utilizando enzimas de restrição; clonagem das moléculas de DNA digeridas; reação de PCR; sequenciamento do gene da quitinase; análise das sequências a serem obtidas.

 

 

REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS

 

BLIFFELD, M.; Mundy, J.; Potrykus, I. & Fütterer, J. (1999). Genetic engineering of wheat for increased resistance to powdery mildew disease. Theor. Appl. Genet. 98:1079-1086.

 

GOMES, R. C.; Sêmedo, L. T. A. S.; Soares, R. M. A.; Alviano, C. S.; Linhares, L. F. & Coelho, R. R. R. (2000). Chitinolytic activity of actinomycetes from a cerrado soil and their potential biocontrol. Lett. Appl. Microbiol. 30:146-150.

 

INOUE, H.; Nojima, H. & Okayama, H. (1990). High efficiency of Escherichia coli with plasmids. Gene. 96:23-28.

 

ITOH, Y.; Kawase, T.; Nikaidou, N.; Fukada, H.; Mitsutomi, M.; Watanabe, T. & Itoh, Y. (2002). Funtional analysis of the chitin-binding domain of a family 19 chitinase from Streptomyces griseus HUT6037: substrate-binding affinity and cis-dominant increase of antifungal function. Biosci. Biotechnol. Biochem. 66(5):1084-1092.

 

MAHADEVAN, B. & Crawford, D. L. (1997). Properties of the chitinase of the antifungal biocontrol agent Streptomyces lydicus WYEC108. Enzyme Microb. Technol. 20:489-493.

 

MARMUR, J. (1961). A procedure for isolation of deoxyribonucleic acid from microorganisms. J. Mol. Biol. 3:208-218.

 

SHAIKH, S. A. & Deshpande, M. V. (1993). Chitinolytic enzymes: their contribution to basic and applied research. World. J. Microbiol. and Biotechnol. 9:468-475.

 

TSUJIBO, H.; Kubota, T.; Yamamoto, M.; Miyamoto, K. & Inamori, Y. (2003).   Characterization of chitinase genes from an alkaliphilic actinomycete, Nocardiopsis prasina OPC-131. Appl. Environ. Microbiol. 69(2):894-900.

 

 

ÓRGÃOS DE FOMENTO

 

            Este projeto de dissertação a ser desenvolvido conta com o apoio dos seguintes órgãos de fomento: CAPES e FUNAPE.